当センター病院では、各分野の専門医を配置し他の医療機関からの紹介を積極的に受けて、高度で専門的医療を提供できるように努めています。一般外来においても、それぞれの疾患に応じた高度で専門的医療の提供に努めていますが、疾患によってはその病気を専門とする医師が担当することでより高度で専門的治療を提供できることがあるため、専門外来、セカンドオピニオン外来と専門疾病センターを設けて診療を行っています。

専門疾病センターではその疾患を専門とする医師が高度専門的診療を行う点では専門外来と同じですが、当センターではいくつかの疾患について診療科や専門分野を超えたチームにより高度専門的診療を行う体制を組んで診療を行っています。また研究所と協力して新しい診断法・治療法の開発に取り組んでいます。こうした専門疾病センターにより、１つの診療科だけでは対応が難しい病気に診療科を超えて取り組み、また治療法が十分確立していない疾患に対して研究所と連携して先駆的治療を試みることも可能となっています。